tet282021
Diabeti 2. Gjendet burimi i ri për identifikimin e më shumë objektivave terapeutikë
Në një studim të botuar në Cell Reports, një ekip studiuesish të udhëhequr nga Miriam Cnop (Universitè Libre në Bruksel), prezanton një bazë të dhënash të quajtur TIGER (Translational human pancreatic Islet Genotype tissue-Expression Resource), një burim i plotë të dhënash gjenomike të ishujve pankreatikë humanë, lindur për të qartësuar se si ndikon variacioni gjenetik në funksionin e ishujve dhe si përkthehen në informacione terapeutike dhe mjekësi të precizionit për diabetin e tipit 2.
Për të studiuar diabetin, qelizat më të rëndësishme të lidhura me sëmundjen janë ishujt pankreatikë humanë, të cilët janë jashtëzakonisht të vështirë për t'u arritur. Në burimin TIGER, janë grumbulluar të dhënat gjenomike dhe të shprehjes së gjeneve nga mbi 500 mostra të ishujve pankreatikë humanë. "Ky studim u bë i mundur vetëm përmes një bashkëpunimi ndërkombëtar, i cili ofroi qasje në ishujt pankreatikë dhe ekspertizë në kërkimin klinik, gjenomikë, bioinformatikë, në biologjinë qelizore e molekulare dhe në statistika", thotë Cnop-i. "Përmbledhja e këtyre të dhënave gjenomike, transkriptomike dhe epigjenomike të ishujve ka prodhuar një bazë të gjerë të dhënash mbi rrezikun e diabetit të tipit 2 që përmban të dhëna molekulare mbi variantet e rrezikut dhe informacion mbi gjenomën e ishujve", vazhdon ai. Në TIGER, janë identifikuar 32 gjene të reja-objektiv që mund të kontribuojnë në rrezikun e diabetit të tipit 2 dhe ky është vetëm hapi i parë drejt të kuptuarit se si secili prej këtyre varianteve gjenetike shton rrezikun e sëmundjes, informacion thelbësor për gjetjen e objektivave farmakologjikë. E gjitha kjo u bë e mundur vetëm duke përdorur burimet e përllogaritura të Barcelona Supercomputing Center, pasi kompjuterët normalë nuk mund të kishin përpunuar kaq shumë të dhëna.
Studiuesit e bënë punën e tyre publike dhe lehtësisht të aksesueshme për komunitetin e kërkimit mbi diabetin, përmes portalit TIGER (http://tiger.bsc.es). "Burimi TIGER hedh dritë mbi mekanizmat molekularë që nxisin zhvillimin e diabetit dhe do të katalizojë kërkimin e objektivave terapeutikë për lloje të ndryshme të diabetit", përfundojnë autorët.
Cell Reports 2021. Doi: 10.1016/j.celrep.2021.109807
https://doi.org/10.1016/j.celrep.2021.109807